在方舟子遭遇袭击事件发生的两日后,北京市警方已全面启动调查,将方舟子及《财经》杂志编辑方玄昌的袭击事件纳入由北京市公安局侦办范围,并考虑合并调查,力求高效解决。
方舟子在警方请求下,低调处理案件进展,特别提醒采访该事件的记者,避免详细透露其居住情况、地点及周边环境,以防止类似《财经》杂志公开其住址导致的安全隐患。舆论与方舟子均认为,这样的信息泄露为犯罪分子提供了行动便利。
8月29日,方舟子在接受辽宁电视台采访时,表达了对安全的担忧,提及近期一位从事学术打假的记者遭袭的经历。主持节目《王刚讲故事》的王刚在其博客中分享了记者的现场记录。在访谈即将结束时,方舟子提及的担忧似乎预示了不久后的不幸,这一警告在十几分钟后便成真。事后,那位记者第一时间接到方舟子的询问电话,确认是否安全。
为支持方舟子,著名评论员司马南在“悲愤状态”下撰写博客,提议若其为《感动中国》的总导演,会将方舟子作为2010年度候选人的考虑纳入考量,以表彰其对抗伪科学的贡献。《南风窗》杂志此前刊发了关于方舟子的专题报道,揭示了他面对威胁时的生活细节。
方舟子的律师彭剑曾建议他调整出行计划,以便有专人陪同,甚至提议设立基金雇佣专业安保团队,以增强个人安全。然而,习惯独自行动的方舟子并未采纳此建议。他过去常选择乘坐公共交通,但频繁的识别导致他放弃了这一出行方式。
方舟子在个人微博上向亲朋好友表达感激之情,同时也反思了自身遭遇袭击事件的影响。在网络舆论中,双方阵营立场鲜明,争议作家张一一声称方舟子此举是为了自我炒作,以推广即将出版的新书《诺亚方舟》。对此,方舟子明确表示否认,指出这纯属造谣,并强调自己的笔名与《诺亚方舟》无关,强烈谴责此类不实言论及其背后的媒体。